Od njegovog nagrađivanog europskog dirigentskog debija u Koncertnoj dvorani Tivoli u Kopenhagenu 1978. godine Franz Anton Krager je vodio orkestre u Kennedyjevu centru u Washingtonu, Gewandhausu u Leipzigu, moskovskoj Državnoj palači Kremlj, Dvorani Bridgewater u Manchesteru, Dvorani Adrian Boult u Birminghamu, Glazbenom centru Xinghai u Guangzhouu, sidnejskom Opera Houseu, haškom Congresgebouwu, zagrebačkom Lisinskom, Državnoj filharmoniji u Kazanju, Teatru Degollado u Guadalajari i Dvorani za izvedbene umjetnosti Van Wezel u Sarasoti. Surađuje s vodećim glazbenim festivalima kao što su Međunarodna koncertna serija u Lancasteru, Međunarodni umjetnički festival u Lichfieldu i Aberystwythu u Ujedinjenom Kraljevstvu i Nacionalni glazbeni kamp u Interlochenu u SAD-u. Maestro Krager vodio je Houstonski simfonijski orkestar, Ruski državni simfonijski orkestar, Simfonijski orkestar Traverse Cityja u Michiganu, Simfonijski orkestar West Coast s Floride, Rumunjsku državnu filharmoniju, Državnu filharmoniju iz Kazanja, simfonijske orkestre iz Washingtona, Berlina, Londona, Chicaga, Pariza, Singapura, Leipziga, Zagreba, Monterreya, Grosseta, Pordenonea, Ingolstadta, Chichestera, Neussa i Honolulua, a od 2000. do 2004. godine bio je gostujući šef dirigent u Stratfordu u Engleskoj. Godine 2015. imenovan je gostujućim šefom dirigentom Komornog orkestra North Shore iz Chicaga. Krager je glazbeni voditelj i šef dirigent Teksaškog glazbenog festivala i utemeljitelj i umjetnički voditelj ansambla Virtuosi of Houston. Također je predavač, voditelj orkestara i pročelnik Odsjeka za dirigiranje na Glazbenoj školi Moores Sveučilišta u Houstonu, gdje je orkestar i orkestralno dirigiranje doveo na istaknut položaj na državnoj razini. Kragerove izvedbe djela Thomasa Fortmanna, Percyja Graingera, Michaela Horvita, Petera Lieuwena, Roberta Nelsona i Stephena Shewana objavljene su u izdanju diskografskih kuća Divine Art (Métier), Albany, MSR Classics, Newport i HDTT.